Det finns ett flertal israeliska fredsorganisationer som vill verka för en fredlig lösning med palestinierna genom att försöka påverka regimen. Fredsrörelsen har dock varit i en svår kris sedan nederlaget i fredsförhandlingarna i Camp David i juli 2000. Den israeliska allmänheten påverkad av media och av regeringsuttalanden fick den bestämda uppfattningen att palestiniernas ledare Yasser Arafat hade sagt nej till ett mycket generöst erbjudande om fred.

Den största israeliska fredsorganisationen heter Peace Now (Fred Nu) och verkar för ett slut på ockupationen. De vill också att Israel lämnar alla bosättningar på Västbanken och i Gaza.

En organisation som står Fred Nu nära är IPPC (Israeli Palestinian Peace Coalition). De tog initiativ till en gemensam deklaration, kallad Kairodeklarationen (eftersom man möttes i Kairo för att skriva den). Titeln var: ”Nej till blodsutgjutelse – Nej till ockupation, Ja till förhandlingar – Ja till fred.” Den undertecknades den 25 juli 2001 av 50 personer, ungefär hälften palestinier och hälften israeler.

Den mest internationellt kända israeliska fredsorganisationen är Gush Shalom som mest inriktar sig på demonstrationer och aktioner. Deras mål är förutom att stoppa ockupationen att Jerusalem skall vara huvudstad för både palestinier och israeler och att ge de palestinska flyktingarna rätt att återvända till både Israel och det nya Palestina.

Andra mindre organisationer som blivit uppmärksammade är Women in Black (Kvinnor i svart) som varje fredag sedan 1987 stått på Terra Santa platsen i Västra Jerusalem med plakat som kräver ett slut på ockupationen. Israeli Committee Against Home Demolitions ägnar sig åt att hindra förstörelse av hem för palestinier och stoppa den israeliska statens förflyttning av invånare i byar (inne i Israel) som inte erkänts av staten. Courage to refuse (Refusniqs) är militära officerare och soldater i stridande förband som år 2002 hade fått nog av att tjänstgöra i ockuperade områden och vägrade fortsätta. Refusniqs vill få fram ett nytt politiskt beslut och tvinga fram ett slut på ockupationen genom att vägra tjänstgöra på de ockuperade områdena.